VÚS zaviedol a aplikuje systém manažérstva kvality podľa normy ISO 9001 v oblasti „aplikovaného výskumu pre potreby komplexného rozvoja elektronických komunikačných poštových sietí a súvisiacich služieb“ od roku 2006.

Certifikačný orgán CERTICOM potvrdil, že VÚS spĺňa požiadavky systému manažérstva kvality podľa citovanej normy. Systém manažérstva kvality bol opakovane potvrdený certifikačným orgánom CERTICOM v nasledujúcich obdobiach (2009 a 2012).

Systém manažérstva kvality sa zameriava na maximálne uspokojovanie požiadaviek a potrieb zákazníkov.